2011年本实验室共获各类奖项8项，详细情况如下：
l 孙卫国教授荣获重新市科技进步三等奖(第三参加人)。
l 张耀鸿等的论文《互花米草入侵和氮沉降对滨海湿地甲烷排放的影响》获得南京市第九届自然科学优秀学术论文三等奖。
l 肖薇等的论文《A modeling investigation of canoy-air oxygen isotopic exchange of water vapor and carbon dioxide in a soybean field》获得南京市第九届自然科学优秀学术论文优秀奖。
l 王艳玲等的《长期施肥下红壤磷素积累的环境风险分析》获得南京市第九届自然科学优秀学术论文优秀奖。
l 江晓东等论文《UV-B辐射增强对保护性耕作冬小麦光合特性的影响》获第28届中国气象学会年会优秀论文奖。
l 申双和教授参加的“行业特色高校“三个导向”分类人才培养体系的构建与实践”课题获2011年江苏省高等教育教学成果特等奖。
l 申双和教授、杨沈斌副教授参加的“依托局校共建，构建现代气象人才实践能力培养体系”获得2011年江苏省高等教育教学成果一等奖。
l 江晓东副教授制作的《植物生理学》多媒体课件获“第十一届全国多媒体课件大赛”优秀奖。